【前沿】TDP-43与甲型流感病毒NP蛋白mRNA互作影响病毒复制

法国巴斯德研究所在《Nucleic Acids Research》上发表题为“The RBPome of influenza A virus NP-mRNA reveals a role for TDP-43 in viral replication”的文章，通过eRIC方法筛选甲流病毒核蛋白NP的mRNA的互作蛋白，发现TDP-43能与多种流感病毒mRNA结合，并且其在促进病毒复制方面发挥重要作用。

 作者首先使用了增强型RNA相互作用组捕获方法(eRIC)，其具体原理是在甲流病毒感染的情况下通过使用LNA探针将NP mRNA与其互作蛋白锁定，并通过更严格的洗脱去除背景。对洗脱液的蛋白组分析鉴定出了16个高度可信的互作蛋白。

 随后作者通过沉默鉴定出的16个互作蛋白，发现hnRNPA2B1、hnRNPH1、TDP-43、SF3A3和SF3B4都能促进病毒的感染，并通过CLIP-qPCR验证其能与NP-mRNA结合而不与病毒NP-vRNA和NP-cRNA结合，其中TDP-43和hnRNPH1的结合能力最强。    

接着作者将目标放在了TDP-43上，通过对A549进行TDP-43敲除发现IAVs、WSN和RSV的复制都收到抑制。

接着作者验证了TDP-43是否对流感病毒其他的mRNA具有结合能力，结果显示TDP-43还能与病毒的聚合酶发生互作。

最后作者发现TDP-43与病毒聚合酶之间的互作不涉及TDP-43的N端结构域。

该研究为更好地了解病毒复制机制，寻找抗病毒药物潜在靶点提供新的证据支持。

编辑 老Q

来源 Caolab